田園洞遺址外觀圖受訪者供圖
零落成泥碾作塵，只有香如故。
數(shù)萬(wàn)年前古人類的基因組也可以從化石中提取出來(lái)，也可以測(cè)序?
國(guó)際上最新的古DNA技術(shù)，讓數(shù)萬(wàn)年甚至幾十萬(wàn)年前古人類的DNA從人類化石甚至土壤中獲得，成為一種可能。
北京房山的田園洞曾出土一具四萬(wàn)年前男性的骨骼化石。中國(guó)科學(xué)院古脊椎動(dòng)物與古人類研究所的研究人員從其富含細(xì)菌和真菌DNA污染的化石樣品中，通過(guò)他們和德國(guó)合作團(tuán)隊(duì)一同開(kāi)發(fā)的一種特殊的捕獲技術(shù)，將混雜在大量微生物DNA中極其微量的古人類的DNA篩選出來(lái)，并進(jìn)行了測(cè)序。
由此，中國(guó)地區(qū)古人類的第一個(gè)基因組、整個(gè)東亞地區(qū)最古老的人類基因組誕生。
科學(xué)家們對(duì)這一難得的基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行了充分研究，他們將其與世界范圍內(nèi)各種人群的基因組數(shù)據(jù)等進(jìn)行了比對(duì)。研究最終證實(shí)，田園洞人屬于古東亞人，但他并非現(xiàn)代東亞人的直接祖先。也就是說(shuō)，田園洞人這一支系的東亞人沒(méi)能繁衍至今。
科學(xué)家驚訝地發(fā)現(xiàn)，四萬(wàn)年前，雖然田園洞人居住在中國(guó)北京房山地區(qū)，他們卻跟來(lái)自比利時(shí)的古歐洲人有遺傳聯(lián)系。但這并不意味著北京田園洞人擁有歐洲血統(tǒng)。此外，研究人員發(fā)現(xiàn)，在美洲土著的各個(gè)人群中，美洲的亞馬遜人與北京田園洞人的遺傳關(guān)系最近。
10月13日，該論文在線發(fā)表在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊《現(xiàn)代生物學(xué)》(Current Biology)上，標(biāo)題為題為“四萬(wàn)年前亞洲人為歐亞早期人群結(jié)構(gòu)提供新洞見(jiàn)”(40,000-Year-Old Individual from Asia Provides Insight into Early Population Structure in Eurasia)。
該研究項(xiàng)目由中國(guó)科學(xué)院古脊椎動(dòng)物與古人類研究所研究員付巧妹、Melinda Yang、高星、同號(hào)文與德國(guó)馬普進(jìn)化人類研究所等團(tuán)隊(duì)合作完成。
神奇技術(shù)可釣取零落在化石中數(shù)萬(wàn)年前古人類的DNA
在德國(guó)進(jìn)行研究時(shí)，付巧妹與合作者開(kāi)發(fā)了從樣品中“釣取”古人類基因組的技術(shù)方法，該論文2013年發(fā)表在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊《美國(guó)科學(xué)院院刊》(PNAS)上。
12日晚，參與該研究的中科院古脊椎動(dòng)物與古人類研究所研究員付巧妹告訴澎湃新聞(www.thepaper.cn)，受到該方法的啟示，全球更多研究人員開(kāi)始嘗試釣取，并拼接出不同年代、不同地區(qū)的古人類基因組。僅從2015年到2017年下半年，已經(jīng)有超過(guò)6篇關(guān)于古人類基因組研究的論文發(fā)表在國(guó)際頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊上，如自然雜志。
在這個(gè)神奇的技術(shù)中，他們要合成一系列特殊的DNA探針，當(dāng)作魚鉤，在泥土、化石等樣品中釣想要的古人類DNA。
用這樣的方法，2013年，付巧妹拼接出古人類田園洞人的第21號(hào)染色體?，F(xiàn)在，她又釣取并拼接出另外幾十條染色體，得到第一個(gè)來(lái)自中國(guó)的古人類的整個(gè)基因組。
但付巧妹向澎湃新聞強(qiáng)調(diào)，這個(gè)釣取并拼接成的基因組，并非完整的基因組。它還缺失了很多基因片段。但這個(gè)田園洞人基因組測(cè)序數(shù)據(jù)涵蓋了整個(gè)基因組上研究人員最感興趣的群體遺傳學(xué)基因的位點(diǎn)。所以，更準(zhǔn)確地說(shuō)，這是全基因組水平上的測(cè)序數(shù)據(jù)。
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